MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Pelagibacter sp. IMCC9063 chromosome

Total Repeats: 1943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015380	T	7	7	15	21	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015380	TTAA	2	8	40	47	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015380	CTT	2	6	56	61	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015380	T	6	6	68	73	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015380	T	6	6	172	177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015380	GCT	2	6	259	264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015380	TCT	2	6	328	333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015380	GTG	2	6	376	381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015380	ATA	2	6	388	393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015380	TAA	2	6	421	426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015380	A	6	6	436	441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015380	TAT	2	6	464	469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015380	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015380	ATTT	2	8	8505	8512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015380	TAAAA	2	10	8543	8552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015380	TAT	2	6	10373	10378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015380	TAA	2	6	10418	10423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015380	CCA	2	6	10457	10462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015380	TTTC	2	8	10510	10517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015380	TGC	2	6	10577	10582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015380	TTAA	2	8	10583	10590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015380	TTAA	2	8	10597	10604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015380	TAA	2	6	11932	11937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015380	TC	3	6	11975	11980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015380	CA	3	6	12004	12009	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015380	TAGT	2	8	12093	12100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015380	CAC	2	6	12145	12150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015380	TATTGT	2	12	12170	12181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015380	AT	3	6	12184	12189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015380	TAAT	2	8	12220	12227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015380	TC	3	6	12231	12236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015380	CCA	2	6	12240	12245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015380	GTC	2	6	12246	12251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015380	TTTA	2	8	12290	12297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015380	TTAA	2	8	12329	12336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015380	CAAAT	2	10	12348	12357	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015380	A	8	8	12360	12367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015380	TAC	2	6	12370	12375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015380	AAT	2	6	12391	12396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015380	T	9	9	12443	12451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015380	A	6	6	12459	12464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015380	ATT	2	6	13327	13332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015380	A	6	6	13361	13366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015380	TCA	2	6	13367	13372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015380	CTA	2	6	13384	13389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015380	AATC	2	8	13426	13433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015380	CGA	2	6	13437	13442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015380	TTA	2	6	14916	14921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015380	ATT	2	6	14934	14939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015380	ACT	2	6	15671	15676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015380	TCT	2	6	15909	15914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015380	TTG	2	6	15926	15931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015380	AGATT	2	10	17623	17632	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015380	TGA	2	6	17648	17653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015380	A	6	6	18432	18437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015380	AAC	2	6	18463	18468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015380	A	7	7	18482	18488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015380	A	6	6	18530	18535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015380	TA	3	6	19116	19121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015380	T	9	9	22129	22137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015380	AGGT	2	8	22167	22174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015380	CTA	2	6	22260	22265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015380	GAAA	2	8	22296	22303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015380	A	6	6	22301	22306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015380	GA	3	6	22307	22312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015380	GAA	2	6	22337	22342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015380	T	8	8	22371	22378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015380	CAAC	2	8	22466	22473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015380	TGG	2	6	22492	22497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015380	TGG	2	6	22501	22506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015380	ATT	2	6	25407	25412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015380	AGA	2	6	25416	25421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015380	T	9	9	25498	25506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015380	AT	3	6	25669	25674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015380	AAT	2	6	26580	26585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015380	T	8	8	26591	26598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015380	AAT	2	6	26704	26709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015380	TAT	2	6	26727	26732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015380	ATT	2	6	26777	26782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015380	TTA	2	6	26785	26790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015380	A	7	7	26825	26831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015380	ATAA	2	8	26889	26896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015380	TAA	2	6	26907	26912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015380	TTTCAC	2	12	29228	29239	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015380	TTAA	2	8	29274	29281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015380	TAA	2	6	29289	29294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015380	TAA	2	6	29301	29306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015380	A	6	6	29305	29310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015380	TAT	2	6	30613	30618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015380	AAT	2	6	30689	30694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015380	AGT	2	6	34569	34574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015380	TA	3	6	34799	34804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015380	AACA	2	8	34831	34838	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015380	T	7	7	36943	36949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015380	T	6	6	36954	36959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015380	C	6	6	38769	38774	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_015380	TAA	2	6	40869	40874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015380	ATT	2	6	40878	40883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015380	ATA	2	6	40913	40918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015380	TCA	2	6	42127	42132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015380	TAC	2	6	42195	42200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015380	CTA	2	6	42205	42210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015380	ATATA	2	10	47116	47125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015380	T	10	10	47881	47890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015380	ATTA	2	8	52658	52665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015380	A	6	6	52674	52679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015380	A	8	8	52688	52695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015380	ATT	2	6	52745	52750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015380	TAA	2	6	52759	52764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015380	A	6	6	52763	52768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015380	TAAA	2	8	52770	52777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015380	T	8	8	53218	53225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015380	T	6	6	53254	53259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015380	TTAT	3	12	53293	53304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015380	ATT	2	6	54059	54064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015380	TAT	2	6	54082	54087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015380	AAATA	2	10	55722	55731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015380	CAA	2	6	55753	55758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015380	AAT	2	6	55765	55770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015380	TTA	2	6	55786	55791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015380	A	8	8	55808	55815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015380	ATT	2	6	55854	55859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015380	TGA	2	6	57582	57587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015380	TTA	2	6	57592	57597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015380	T	6	6	57618	57623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015380	ATC	2	6	57626	57631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015380	TAAATT	2	12	57637	57648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015380	TTTG	2	8	58262	58269	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015380	TAC	2	6	58273	58278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015380	AGAAT	2	10	58284	58293	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015380	TGT	2	6	58325	58330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015380	AAT	2	6	59381	59386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015380	TAT	2	6	59668	59673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015380	ATC	2	6	62904	62909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015380	AAGA	2	8	62926	62933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015380	ACT	2	6	62949	62954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015380	A	6	6	62957	62962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015380	TTA	2	6	62968	62973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015380	A	7	7	63032	63038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015380	T	6	6	63039	63044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015380	ATT	2	6	63057	63062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015380	T	7	7	63066	63072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015380	A	7	7	67754	67760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015380	ATT	2	6	67794	67799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015380	T	10	10	67798	67807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015380	AAT	2	6	67818	67823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015380	T	9	9	67833	67841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015380	TTA	2	6	67854	67859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015380	A	8	8	67893	67900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015380	GAAT	2	8	70834	70841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_015380	T	6	6	70879	70884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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